據報道,深圳華大基因研究院發表的新聞公報說,在一項由該研究院、德國漢堡-埃彭多夫大學醫學院、中國疾病預防與控制中心和軍事醫學科學院微生物流行病研究所聯合進行的研究中,研究人員利用第三代測序儀“Ion Torrent”對在德國流行的病菌進行了全基因組測序,并通過對序列的分析發現該菌株屬于血清型O104大腸桿菌。
但是,O104型大腸桿菌以前未見引起人類大規模感染的報道。研究人員通過進一步比對分析發現該菌株與2002年從中非艾滋病患者腹瀉標本中分離的腸聚集性大腸桿菌55989菌株的同源性超過93%。
對基因序列的分析結果顯示,導致德國疫情的菌株通過基因水平轉移獲得了腸出血性大腸桿菌的毒力基因和毒力相關質粒,這可能與該菌株強毒性和重癥感染有關。
研究還發現,該菌株攜帶氨基糖甙類、大環內酯類、磺胺類等抗生素的耐藥基因,導致抗生素治療無效。
3天就測出病菌
漢堡-埃彭多夫大學醫學院細菌專家羅德2日說,這項德中聯合研究在德國流行的致病菌中發現了兩種完全不同的細菌的部分基因。這一新組合有利于病菌在腸細胞上附著,從而使其能在腸道內宿居更長時間,造成更大的破壞。此外,這種病菌還對抗生素具有很強的抗藥性。羅德稱這種新型病菌“是常見的腸出血性大腸桿菌的一個非常遠的遠親”。
據中國深圳華大基因研究院介紹,德國大腸桿菌疫情發生后,該研究院立即與德方研究機構建立聯系開展合作,并成立專門研究小組對該細菌進行測序和生物信息學分析。在獲得病菌樣本后3天的時間內,華大基因就完成了對這種新型大腸桿菌的基因組測序。
肆虐歐洲的是新型超毒性大腸桿菌;抗藥性強,與艾滋病患者所攜病菌是近親
這是5月30日德國羅伯特·科赫研究所提供的腸出血性大腸桿菌的電子顯微鏡照片。